Modele ab initio

En règle générale, les documents ou les actes qui sont nuls ab initio ne peuvent pas être résolus et si une juridiction, un document ou un acte est déclaré en droit comme nul ab initio, les parties sont retournées à leurs positions respectives qu`elles étaient au début de l`événement. “Void ab initio” est souvent comparé à “annulable”, ces documents ne devenant nuls qu`à la date de la déclaration judiciaire à cet effet. Les meilleures méthodes modernes de prédiction de structure secondaire dans les protéines atteignent environ 80% de précision; [3] cette précision élevée permet l`utilisation des prédictions comme fonction améliorant la reconnaissance de pli et la prédiction de structure de protéine ab initio, la classification des motifs structuraux, et le raffinement des alignements de séquence. La précision des méthodes actuelles de prédiction de la structure secondaire des protéines est évaluée dans des repères hebdomadaires tels que LiveBench et EVA. La prédiction de la structure protéique reste une entreprise extrêmement difficile et non résolue. Les deux principaux problèmes sont le calcul de l`énergie sans protéines et la recherche du minimum mondial de cette énergie. Une méthode de prédiction de la structure protéique doit explorer l`espace des structures protéiques possibles qui sont astronomiquement grandes. Ces problèmes peuvent être partiellement contourné dans la modélisation «comparative» ou homologique et les méthodes de reconnaissance de pli, dans lequel l`espace de recherche est taillé par l`hypothèse que la protéine en question adopte une structure qui est proche de la déterminée expérimentalement structure d`une autre protéine homologue. D`autre part, les méthodes de prédiction de la structure protéique de Novo ou ab initio doivent résoudre explicitement ces problèmes. Les progrès et les défis dans la prédiction de la structure protéique ont été examinés dans Zhang 2008. Un grand nombre d`outils logiciels pour la prédiction de la structure protéique existent [26]. Les approches comprennent la modélisation de l`homologie, le filetage des protéines, les méthodes ab initio, la prédiction de la structure secondaire et la prédiction de peptide de signal et d`hélice transmembranaire. Certaines méthodes récemment réussies basées sur les expériences du CASP comprennent I-TASSER et HHpred.

Pour la liste complète, voir l`article principal. Une nouvelle technique de prédiction de la structure des protéines ab initio, basée sur les parcelles de Ramachandran, est actuellement étudiée à l`Université de l`Iowa, sous la direction du Prof. Alberto M. Segre, en collaboration avec l`Institut des mathématiques computationnelles, IMC-CNR Pise. Ab initio (/ˌ æbɪ ˈ nɪʃi. supérieur/AB-i-NISH-EE-OH) [1] est un terme latin signifiant “depuis le début” et dérivé du latin AB (“from”) + initio, ablatif singulier d`initium (“commencement”). Le serveur d`évaluation des modèles automatisés continus CAMEO3D évalue les serveurs de prédiction automatisés de structure protéique sur une base hebdomadaire en utilisant des prédictions aveugles pour les structures protéiques nouvellement relâchement. CAMEO publie les résultats sur son site Web. Un assureur faisant face à une créance d`un assuré qui avait trompé l`assureur sur un fait important alléirait que le contrat d`assurance était nul ab initio; elle était nulle et non avenue dès le début et qu`étant donné qu`il n`existait pas de contrat juridiquement exécutoire, l`assureur ne devait pas avoir à payer. [3] Comment peut-on prédire l`état natif d`une protéine (soit l`exacte ou le pli global approximatif)? Il existe trois approches majeures à ce problème: modélisation comparative, Threading et prédiction ab initio.

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